Trouver le bon logiciel de facturation électronique est devenu essentiel pour toute entreprise française. Avec la réforme 2026, qui impose l'échange de factures électroniques via une plateforme agréée par la DGFiP, le choix de votre solution de facturation impacte directement votre conformité légale et votre efficacité administrative. Notre comparatif couvre les 136 logiciels facturation électronique agréés DGFiP, du plus simple (gratuit et sans engagement) au plus complet (ERP multi-entités), pour vous aider à trouver la plateforme adaptée à votre structure et votre budget.
Un logiciel facturation moderne doit désormais bien plus que générer un PDF : il doit permettre l'émission et la réception de factures conformes au standard Factur-X, intégrer la comptabilité, synchroniser les paiements bancaires et communiquer avec l'administration fiscale. Qu'il soit gratuit (comme Tiime, Abby ou Chorus Pro) ou premium (Pennylane, Axonaut, Sage), votre logiciel facturation électronique doit justifier sa place dans votre écosystème. Dans ce guide, nous avons testé les principales solutions et les classons selon les critères qui comptent vraiment : agrément DGFiP, facilité d'usage, rapport fonctionnalités/prix, support client et intégrations.
Besoin d'aide pour choisir ? Utilisez notre quiz de recommandation (2 min), explorez nos profils métier ci-dessous, ou consultez notre liste des 136 plateformes agréées. Découvrez aussi notre guide complet sur la facturation électronique obligatoire pour comprendre les enjeux et les délais.
Top 10 des logiciels de facturation en 2026
Classement basé sur nos tests : fonctionnalités, ergonomie, rapport qualité/prix, support et intégrations.
Axonaut
PA agrééeCRM + facturation tout-en-un français. Gestion commerciale, comptabilité et RH dans une seule interface.
70€/mois
TPE/PME cherchant un outil tout-en-un (CRM + facturation)
Sellsy
PA agrééeSuite CRM et gestion commerciale pour PME. Du devis à la facture électronique en une seule plateforme.
29€/mois
PME et ETI avec équipe commerciale structurée
Tiime
PA agrééeGratuitFacturation électronique gratuite et illimitée pour indépendants et TPE. Offres payantes avec comptabilité intégrée.
Gratuit
Indépendants et TPE cherchant une solution gratuite ou abordable
Pennylane
PA agrééeComptabilité et facturation tout-en-un pour TPE/PME. Interface moderne, collaboration expert-comptable en temps réel.
14€/mois
TPE/PME avec expert-comptable
Indy
PA agrééeGratuitComptabilité et facturation 100% gratuite pour indépendants. Plateforme agréée, 90 000+ utilisateurs. 1er mois offert.
Gratuit
Indépendants, professions libérales et TPE
Qonto
PA agrééeNéobanque pro n°1 en France + facturation électronique Plateforme Agréée. Banque + factures dès 9€/mois.
9€/mois
Entreprises cherchant une solution bancaire + facturation
Spendesk
PA agrééeSpend management tout-en-un. Cartes, factures, budgets. PA certifiée pour PME et startups.
Sur devis
PME et startups en croissance
Shine
PA agrééeGratuitCopilote administratif tout-en-un : compte pro + facturation + estimateur de charges. Élu service client 2026. Essai 30 jours gratuit.
Gratuit
Indépendants et TPE avec besoin de compte pro
Evoliz
Facturation et gestion commerciale en ligne. Simple, complet et abordable pour indépendants et TPE.
16€/mois
Indépendants, artisans et TPE
Esker
PA agrééeLeader AP/AR automation. OCR IA avancée, détection de fraude, Plateforme Agréée pour ETI et grandes entreprises.
Sur devis
ETI et grandes entreprises
Quel logiciel choisir selon votre profil ?
Auto-entrepreneur / Micro-entreprise
Budget serré, peu de factures, besoin de simplicité. Privilégiez une solution gratuite et intuitive.
TPE / Petite entreprise (1-20 salariés)
Besoin de facturation + suivi des paiements + connexion bancaire. Un bon rapport qualité/prix est essentiel.
PME / ETI (20+ salariés)
Besoin d'un ERP complet, multi-entités, gestion avancée et intégrations poussées.
Freelance / Profession libérale
Facturation simple + déclarations URSSAF/BNC + mobilité. L'app mobile est un plus.
Comparatif rapide des logiciels de facturation
| Logiciel | Note | Prix | PA agréée | OCR/IA | App mobile | Cible |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Axonaut | 8.6/10 | 70€/mois | TPE/PME cherchant un outil tout-en-un (CRM + facturation) | |||
| Sellsy | 8.6/10 | 29€/mois | PME et ETI avec équipe commerciale structurée | |||
| Tiime | 8.6/10 | Gratuit | Indépendants et TPE cherchant une solution gratuite ou abordable | |||
| Pennylane | 8.5/10 | 14€/mois | TPE/PME avec expert-comptable | |||
| Indy | 8.5/10 | Gratuit | Indépendants, professions libérales et TPE | |||
| Qonto | 8.4/10 | 9€/mois | Entreprises cherchant une solution bancaire + facturation | |||
| Spendesk | 8/10 | Sur devis | PME et startups en croissance | |||
| Shine | 7.9/10 | Gratuit | — | Indépendants et TPE avec besoin de compte pro | ||
| Evoliz | 7.9/10 | 16€/mois | — | — | — | Indépendants, artisans et TPE |
| Esker | 7.9/10 | Sur devis | ETI et grandes entreprises |
Données mises à jour en mars 2026. Notes basées sur nos tests indépendants. Comparateur facturation électronique →
Les logiciels de facturation gratuits
Vous n'avez pas besoin de payer pour être conforme. Voici les solutions gratuites :
Tiime
Indépendants et TPE cherchant une solution gratuite ou abordable — 8.6/10
Indy
Indépendants, professions libérales et TPE — 8.5/10
Shine
Indépendants et TPE avec besoin de compte pro — 7.9/10
Zoho Books
TPE/PME cherchant une solution internationale — 7.8/10
Abby
Auto-entrepreneurs, freelances, artisans et TPE — 7.6/10
N2F
PME gérant frais et factures — 7.4/10
Comment choisir son logiciel de facturation ?
Avec la réforme 2026, votre logiciel doit obligatoirement être conforme. Voici les critères essentiels :
Agrément DGFiP
Vérifiez que la plateforme est agréée. 136 PA sont certifiées.
Adapté à votre taille
Auto-entrepreneur, TPE, PME ou ETI : les besoins diffèrent.
Budget
De 0€ (Chorus Pro) à 200€+/mois. Comparez le rapport fonctionnalités/prix.
Intégrations
Comptabilité, banque, CRM. Vérifiez les connecteurs disponibles.
Ergonomie et mobile
App mobile, interface intuitive. Testez l'essai gratuit.
Support client
Chat, email, téléphone ? Un bon support est essentiel.
Comment fonctionne un logiciel de facturation électronique ?
Un logiciel de facturation électronique agréé gère l'intégralité du cycle de vie de vos factures, de la création à la transmission à l'administration fiscale.
Création de la facture
Vous créez votre facture dans le logiciel : client, prestations, montants, TVA. Le logiciel calcule automatiquement les taxes et ajoute les mentions légales obligatoires.
Conversion au format structuré
Le logiciel convertit votre facture en Factur-X (PDF + XML), UBL ou CII. Ce format structuré permet le traitement automatique par les logiciels comptables.
Transmission via plateforme agréée
La facture est envoyée via la plateforme agréée (PA) de votre logiciel vers la PA de votre client. Le Portail Public de Facturation (PPF) sert d'annuaire central.
Notification à la DGFiP
Les données de facturation sont automatiquement transmises à l'administration fiscale pour le contrôle TVA en temps réel (e-invoicing et e-reporting).
Suivi et comptabilisation
Vous suivez le statut de chaque facture (envoyée, reçue, payée). Les écritures comptables sont générées automatiquement si votre logiciel intègre la comptabilité.
Quel logiciel de facturation par secteur d'activité ?
Chaque secteur a des besoins spécifiques. Retrouvez nos recommandations détaillées :
Facturation électronique obligatoire dès septembre 2026
Toutes les entreprises françaises devront recevoir des factures électroniques dès le 1er septembre 2026. L'émission sera obligatoire pour tous au plus tard en septembre 2027. Les sanctions vont jusqu'à 15€ par facture non conforme.
Pas sûr de votre choix ?
Notre quiz analyse votre profil (taille, budget, besoins) et vous recommande les 3 meilleures solutions en 2 minutes.
Faire le quiz de recommandationQuestions fréquentes
Quel est le meilleur logiciel de facturation gratuit ?
Tiime et Abby proposent des offres entièrement gratuites et complètes. Chorus Pro (le Portail Public de Facturation) est aussi 100% gratuit sans aucune limite. Pour les micro-entrepreneurs, Henrri est une autre option gratuite populaire.
Quel logiciel de facturation choisir pour un auto-entrepreneur ?
Pour un auto-entrepreneur, les solutions gratuites comme Tiime, Abby ou Henrri sont parfaites. Elles sont simples, conformes à la réforme 2026 et suffisantes pour un faible volume de factures. Si vous avez besoin de comptabilité intégrée, Indy est très adapté aux indépendants.
Quel logiciel de facturation pour une PME ?
Pour une PME, Pennylane, Axonaut ou Sellsy sont les meilleures options. Pennylane excelle en comptabilité collaborative, Axonaut en CRM + facturation, et Sellsy en gestion commerciale complète. Pour les PME industrielles, Cegid ou Sage sont plus adaptés.
Combien coûte un logiciel de facturation ?
De 0€ (Tiime, Abby, Chorus Pro) à plus de 200€/mois pour les solutions ETI/GE (Sage, Cegid, Yooz). La majorité des solutions pour TPE/PME se situent entre 14€ et 50€/mois. Le coût dépend du volume de factures, des fonctionnalités et du nombre d'utilisateurs.
Est-ce obligatoire d'utiliser un logiciel de facturation électronique ?
Oui, à partir de septembre 2026 toutes les entreprises doivent pouvoir recevoir des factures électroniques, et à partir de septembre 2027 toutes doivent en émettre. Vos factures doivent transiter par une plateforme agréée DGFiP dans un format structuré (Factur-X, UBL ou CII).
Quelle différence entre logiciel de facturation et plateforme agréée ?
Un logiciel de facturation est un outil pour créer et gérer vos factures. Une plateforme agréée (PA) est certifiée par la DGFiP pour transmettre les factures électroniques à l'administration. Beaucoup de logiciels modernes sont aussi des plateformes agréées (Pennylane, Tiime, Axonaut, etc.), ce qui simplifie la mise en conformité.