Avec l'obligation de facturation électronique qui entre en vigueur en septembre 2026, choisir le bon logiciel est devenu une priorité pour toutes les entreprises françaises. Voici notre comparatif indépendant des 10 meilleures solutions conformes, testées et notées sur la base de critères objectifs.
Comparatif des 10 meilleurs logiciels de facturation électronique
| # | Logiciel | Prix | PA agréée | Cible | Points forts |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Pennylane | 14€/mois | Oui | TPE/PME | Comptabilité collaborative, OCR, rapprochement bancaire |
| 2 | Tiime | Gratuit | Oui | Auto/TPE | Gratuit et complet, app mobile, interface intuitive |
| 3 | Axonaut | 35€/mois | Oui | TPE/PME | CRM + facturation, tout-en-un, support français |
| 4 | Shine | Dès 0€/mois | En cours | Indépendants/TPE | Copilote administratif : compte pro + facturation + estimateur de charges. Élu service client 2026 |
| 5 | Evoliz | Gratuit* | Oui | Micro/TPE | Gratuit pour micro, interface pro, devis inclus |
| 6 | Indy | Gratuit | Oui | Indépendants | Facturation 100% gratuite, comptabilité BNC, IA |
| 7 | Sellsy | 29€/mois | Oui | PME | Suite commerciale complète, CRM, gestion de trésorerie |
| 8 | INFast | Gratuit* | Oui | Micro/TPE | Ultra-simple, support très réactif, payant dès 6€ |
| 9 | Sage | Sur devis | Oui | PME/ETI | ERP complet, référence historique, multi-entités |
| 10 | Cegid | Sur devis | Oui | PME/ETI/GE | ERP et comptabilité, secteur retail et industrie |
* Gratuit sous conditions (micro-entreprise). Données mises à jour en mars 2026.
Notre avis détaillé sur le top 5
- Pennylane — Le meilleur tout-en-un pour TPE/PME
Pennylane combine facturation électronique, comptabilité collaborative et connexion bancaire dans une interface moderne. Son point fort : la collaboration en temps réel avec votre expert-comptable. Découvrez comment les experts-comptables peuvent utiliser Pennylane. OCR intelligent, rapprochement bancaire automatique et tableau de bord financier complet. Plateforme agréée DGFiP.
Prix : À partir de 14€/mois HT | Essai : 30 jours gratuits | Cible : TPE/PME avec expert-comptable
- Tiime — La meilleure solution gratuite
Tiime se démarque par son offre gratuite complète : facturation illimitée, devis, gestion clients, app mobile et e-facturation conforme. Interface très intuitive, idéale pour les auto-entrepreneurs et TPE qui veulent démarrer sans investir. Explorez notre guide des logiciels de facturation gratuits pour d'autres options. Plateforme agréée DGFiP.
Prix : Gratuit (version premium disponible) | Cible : Auto-entrepreneurs, TPE
- Axonaut — Le meilleur CRM + facturation
Axonaut est la solution française tout-en-un qui combine CRM, facturation, gestion de projets et comptabilité. Idéal pour les TPE/PME de services qui veulent un seul outil pour tout gérer. Support 100% français et très réactif. Plateforme agréée DGFiP.
Prix : À partir de 35€/mois HT | Essai : 15 jours gratuits | Cible : TPE/PME de services
- Shine — Le copilote administratif tout-en-un
Shine fusionne compte bancaire pro, facturation et estimation de charges en un seul outil. Calcul automatique des cotisations URSSAF et TVA, rappels d'échéances fiscales, relances automatiques des impayés. Élu service client de l'année 2026 pour la 3ème année consécutive, certifié B Corp. Plus de 150 000 clients satisfaits.
Prix : Free à 0€/mois, Start à 11€/mois HT | Essai : 30 jours gratuits | Cible : Indépendants et TPE
- Evoliz — Le meilleur pour les micro-entreprises
Evoliz propose une offre gratuite pour les micro-entreprises (CA < 85 000€) avec facturation complète, devis et gestion clients. Interface professionnelle et claire. Passage au payant progressif si votre activité grandit.
Prix : Gratuit (micro) puis à partir de 9€/mois | Cible : Micro-entreprises
Qu'est-ce qu'un logiciel de facturation électronique conforme ?
Avec la réforme 2026, un logiciel de facturation ne suffit plus — il doit être conforme aux nouvelles exigences. Concrètement, il doit :
- Émettre des factures dans un format structuré : Factur-X, UBL 2.1 ou CII
- Transmettre via une plateforme agréée (PA) ou le Portail Public de Facturation (PPF)
- Recevoir des factures électroniques dans les trois formats obligatoires
- Assurer le e-reporting des transactions B2C et internationales
- Archiver les factures pendant 10 ans minimum
- Inclure les mentions obligatoires : SIREN client, adresse livraison, nature opération, TVA débits
Comment choisir le bon logiciel ?
Votre taille d'entreprise
Auto-entrepreneur → Tiime, Abby. TPE → Pennylane, INFast. PME → Axonaut, Sellsy. ETI/GE → Sage, Cegid.
Votre budget
De 0€ (Chorus Pro, Tiime) à 200€+/mois. Consultez notreanalyse des coûts réels.
Vos intégrations existantes
Banque, comptabilité, CRM, e-commerce : vérifiez la compatibilité avant de choisir.
L'agrément DGFiP
Indispensable. Consultez notreannuaire des 108 plateformes agréées.
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Classement complet
Les 23 logiciels notés et comparés côte à côte.